Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skint2A7XUX6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms