Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Herc3A6H6S0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Herc3A6H6S0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms