Protein–RNA interactions for Protein: A6H584

Col6a5, Collagen alpha-5(VI) chain, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a5A6H584 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a5A6H584 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Col6a5A6H584 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Col6a5A6H584 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Col6a5A6H584 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a5A6H584 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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