Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf39A2RT81 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf39A2RT81 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms