Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms