Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rtf1A2AQ19 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtf1A2AQ19 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms