Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tubb1A2AQ07 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb1A2AQ07 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms