Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Frmpd1A2AKB4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Frmpd1A2AKB4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Frmpd1A2AKB4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms