Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ambra1A2AH22 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ambra1A2AH22 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms