Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhbdl2A2AGA4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhbdl2A2AGA4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhbdl2A2AGA4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhbdl2A2AGA4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhbdl2A2AGA4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms