Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem185aA2AF53 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms