Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700023F06RikA2AB62 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms