Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm16A2A935 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm16A2A935 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms