Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Krtap29-1A2A5X4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Krtap29-1A2A5X4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms