Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cul4bA2A432 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4bA2A432 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms