Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam71e1A1L3C1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam71e1A1L3C1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms