Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc173A0JLY1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc173A0JLY1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms