Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac6Q9Z2V5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac6Q9Z2V5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms