Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp5Q9Z2P8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms