Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn8Q9Z260 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms