Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trip6Q9Z1Y4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip6Q9Z1Y4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms