Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
D17h6s53eQ9Z1R4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
D17h6s53eQ9Z1R4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms