Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Padi3Q9Z184 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Padi3Q9Z184 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Padi3Q9Z184 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Padi3Q9Z184 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Padi3Q9Z184 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Padi3Q9Z184 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Padi3Q9Z184 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Padi3Q9Z184 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms