Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apobec2Q9WV35 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec2Q9WV35 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.71■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec2Q9WV35 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms