Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms