Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Abcc6Q9R1S7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Abcc6Q9R1S7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms