Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim3Q9R1R2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim3Q9R1R2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms