Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Taf7Q9R1C0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Taf7Q9R1C0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf7Q9R1C0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms