Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0P4

Smap, Small acidic protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmapQ9R0P4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmapQ9R0P4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmapQ9R0P4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmapQ9R0P4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmapQ9R0P4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SmapQ9R0P4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmapQ9R0P4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmapQ9R0P4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmapQ9R0P4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmapQ9R0P4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmapQ9R0P4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmapQ9R0P4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms