Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Plod1Q9R0E2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Plod1Q9R0E2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms