Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Lamc3Q9R0B6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Lamc3Q9R0B6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Lamc3Q9R0B6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
Lamc3Q9R0B6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lamc3Q9R0B6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms