Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Npas3Q9QZQ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms