Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZN3

Fbxo8, F-box only protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo8Q9QZN3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo8Q9QZN3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo8Q9QZN3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms