Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp21Q9QZL6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp21Q9QZL6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp21Q9QZL6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms