Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ercc4Q9QZD4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc4Q9QZD4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms