Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Map1aQ9QYR6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Map1aQ9QYR6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms