Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL0

Hils1, Spermatid-specific linker histone H1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hils1Q9QYL0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hils1Q9QYL0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hils1Q9QYL0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms