Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Rdh11Q9QYF1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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Rdh11Q9QYF1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rdh11Q9QYF1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Rdh11Q9QYF1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Rdh11Q9QYF1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Rdh11Q9QYF1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh11Q9QYF1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Rdh11Q9QYF1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Rdh11Q9QYF1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Rdh11Q9QYF1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Rdh11Q9QYF1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Rdh11Q9QYF1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rdh11Q9QYF1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rdh11Q9QYF1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rdh11Q9QYF1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdh11Q9QYF1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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