Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp1Q9QY53 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms