Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn4Q9QXZ9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn4Q9QXZ9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms