Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nufip1Q9QXX8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nufip1Q9QXX8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms