Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx8Q9QXV1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx8Q9QXV1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cbx8Q9QXV1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms