Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trp53inp1Q9QXE4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trp53inp1Q9QXE4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms