Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Homer2Q9QWW1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer2Q9QWW1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms