Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rai2Q9QVY8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms