Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dkk3Q9QUN9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dkk3Q9QUN9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dkk3Q9QUN9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dkk3Q9QUN9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dkk3Q9QUN9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dkk3Q9QUN9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dkk3Q9QUN9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dkk3Q9QUN9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dkk3Q9QUN9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dkk3Q9QUN9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dkk3Q9QUN9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dkk3Q9QUN9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms