Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cln8Q9QUK3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cln8Q9QUK3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms