Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PolkQ9QUG2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PolkQ9QUG2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms