Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rabgef1Q9JM13 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rabgef1Q9JM13 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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