Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Tgm1Q9JLF6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm1Q9JLF6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms